Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms