Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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