Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms