Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms