Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms