Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EgfrQ01279 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms