Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms