Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms