Protein–RNA interactions for Protein: P97805

Fam3d, Protein FAM3D, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3dP97805 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam3dP97805 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms