Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gfra1P97785 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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