Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Npas1P97459 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Npas1P97459 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Npas1P97459 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Npas1P97459 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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