Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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