Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.6 ms