Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms