Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msx3P70354 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msx3P70354 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msx3P70354 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms