Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb13P70321 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms