Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms