Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrig1P70193 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms