Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms