Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabra1P62812 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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