Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms