Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps18P62270 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms