Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms