Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2kP61087 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms