Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcbp1P60335 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms