Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms