Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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