Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd38P56528 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms