Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GferP56213 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GferP56213 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GferP56213 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms