Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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