Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fgd1P52734 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms