Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TspoP50637 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms