Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FmodP50608 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
FmodP50608 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms