Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VdrP48281 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms