Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx1-2P42580 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms