Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtbP41155 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LtbP41155 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LtbP41155 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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