Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VhlP40338 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VhlP40338 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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VhlP40338 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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VhlP40338 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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VhlP40338 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VhlP40338 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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