Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms