Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf1P39428 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf1P39428 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms