Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms