Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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