Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms