Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Hoxc11P31313 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Hoxc11P31313 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Hoxc11P31313 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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