Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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