Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hoxd10P28359 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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