Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Defa3P28310 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa3P28310 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa3P28310 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms