Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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