Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms