Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ggta1P23336 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms