Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3aP23116 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms